質(zhì)粒大量提試劑盒說明書 本試劑盒采用堿裂解法裂解細胞,根據(jù)離心吸附柱在高鹽狀態(tài)下特異性地結(jié)合溶液中的DNA的原理特異性提取質(zhì)粒DNA。 離心吸附柱中采用的硅基質(zhì)材料能高效、專一地吸附DNA,可大限度去除雜質(zhì)蛋白及細胞中其他有機化合物,一般從50-100ml大腸桿菌LB培養(yǎng)液中,可快速提取200-300μg高純度高拷貝的質(zhì)粒DNA,提取率達85-90%。 使用本試劑盒提取的質(zhì)粒DNA可適用于各種常規(guī)操作,包括酶切、PCR、測序、連接和轉(zhuǎn)化等試驗。 使用前請先在漂洗液中加入無水乙醇,加入體積請參照瓶體上的標簽。溶液Ⅰ在使用前先加入RNaseA(將試劑盒中提供的 RNaseA 全部加入),混勻,置于 2-8℃保存。如非指明,所有離心步驟均為使用臺式離心機在室溫下離心。 操作步驟: 1. 收集50-100ml培養(yǎng)的菌液11000rpm離心10分鐘,盡量吸除上清(菌液較多時可以通過多次離心將菌體沉淀收集到一個離心管中)。 2. 向留有菌體沉淀的離心管中加入5ml溶液Ⅰ (請先檢查是否已加入RNaseA) ,使用移液器或渦旋振蕩器*懸浮細菌細胞沉淀。注意:如果菌塊未*混勻,會影響裂解導(dǎo)致質(zhì)粒提取量和純度偏低。 3. 向離心管中加入5ml溶液Ⅱ ,溫和地上下翻轉(zhuǎn)6-8次使菌體充分裂解。 注意:①翻轉(zhuǎn)一定要溫和,以免污染細菌基因組DNA。②作用時間不要超過5分鐘,以免質(zhì)粒受到破壞。 4. 向離心管中加入7ml溶液Ⅲ ,立即溫和地上下翻轉(zhuǎn)6-8次,充分混勻,此時會出現(xiàn)白色絮狀沉淀(如菌液過多,可在此步放置5分鐘,以盡可能的降解RNA)。11000rpm離心10分鐘,用移液器小心地將上清轉(zhuǎn)移到另一個干凈的離心管中,注意盡量不要吸出沉淀。 注意:溶液Ⅲ加入后應(yīng)立即混勻,避免產(chǎn)生局部沉淀。 如果上清中還有微小白色沉淀,可再次離心后取上清。 5. 將上一步所得上清液加入吸附柱中(吸附柱放入收集管中),室溫放置2-3分鐘,11000rpm離心30-60秒,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中(如為提高得率,可將收集管中的液體加入吸附柱再次吸附一次)。 6. 向吸附柱中加入8ml漂洗液(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),11000rpm離心2min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。 7. 向吸附柱中加入6ml漂洗液,11000rpm離心2min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。 8. 11000rpm離心5min,將吸附柱敞口置于室溫或50℃溫箱放置數(shù)分鐘,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,否則漂洗液中的乙醇會影晌后續(xù)的實驗如酶切、PCR等。 9. 將吸附柱放入一個干凈的離心管中,向吸附膜*懸空滴加1-2ml經(jīng)65℃水浴預(yù)熱的洗脫液,室溫放置5min,11000rpm離心2min,收集質(zhì)粒溶液用于后續(xù)實驗。 10. 為了增加質(zhì)粒的回收效率,可將得到的洗脫液重新加入吸附柱中,室溫放置5min, 11000rpm離心2min。 注意事項: 1. 使用前請先檢查溶液Ⅱ和溶液Ⅲ是否出現(xiàn)混濁,如有混濁現(xiàn)象,可在37℃水浴中加熱幾分鐘,待溶液恢復(fù)澄清后再使用。溶液Ⅱ 、溶液Ⅲ和漂洗液使用后應(yīng)立即擰緊蓋子。 2. 洗脫緩沖液體積不應(yīng)少于500ul,體積過小影響回收效率;洗脫液的pH值對洗脫效率也有影晌,若需要用水做洗脫液應(yīng)保證其pH值在8.0左右(可用NaOH將水的pH值調(diào)此范圍), pH值低于7. 0會降低洗脫效率。 DNA產(chǎn)物應(yīng)保存在-20℃,以防DNA降解。 3. 如果所提質(zhì)粒為低拷貝質(zhì)?;虼笥?0kb的大質(zhì)粒,應(yīng)加大菌體使用量,使用400-800ml培養(yǎng)物,同時按照比例增加溶液Ⅰ 、溶液Ⅱ和溶液Ⅲ的用量,吸附和洗脫時可以適當(dāng)?shù)难娱L時間,以增加提取效率。 4. DNA濃度及純度檢測:得到的質(zhì)粒DNA純度與樣品保存時間、操作過程中的剪切力等因素有關(guān)。 得到的DNA可用瓊脂糖疑膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與純度。 DNA應(yīng)在OD260處有顯著吸收峰,OD260值為1相當(dāng)于大約50μg/ml雙鏈DNA、 40μg/ml單鏈DNA。OD260/OD280比值應(yīng)為1.7-1.9,如果洗脫時不使用洗脫緩沖液,而使用去離子水,比值會偏低,因為pH值和離子存在會影響吸光值,但并不表示純度低。 相關(guān)產(chǎn)品: E1020 EB染色液 D1010 6×DNA Loading Buffer T1060 50×TAE 緩沖液 T1050 5×TBE 緩沖液 M1060 D2000 DNA Ladder M1400 1kb DNA Ladder G8142 GoldView II型核酸染色劑(5000×) |